跨境校巴是指已獲政府簽發特別配額為跨境學童提供跨境接送服務的跨境巴士。有關跨境巴士營辦商必須持有相關管制站的跨境巴士常規配額，方可提出特別配額的申請。
2024/25學年合資格乘坐跨境校巴的跨境學童如下：
文錦渡、香園圍、深圳灣及落馬洲（皇崗）管制站適用
在深圳居住及就讀於全港各區幼稚園、小學或中學的跨境學童
港珠澳大橋香港口岸適用
在珠海居住及就讀於全港各區幼稚園、小學或中學的跨境學童
有關跨境校巴的特別配額
政府每年均會重新審批跨境校巴特別配額的申請，一般會於每年5月至6月期間處理下學年的申請。家長應與學校及營辦商保持緊密聯繫，以便及早知悉下學年交通安排。家長亦可瀏覽本網頁，以了解相關的資訊。
2024/25學年獲發特別配額的跨境校巴營辦商資料（有效期至2025年7月）（排名不分先後）
管制站 | 跨境校巴營辦商 | 聯絡電話 | 聯絡電話 （内地） |
|---|---|---|---|
深圳灣管制站 | 廣東長虹旅遊客運有限公司 | 6081 7305 | (+86) 139 2522 3492 |
深圳灣管制站 | 香港中旅汽車服務有限公司 | 6072 0219 2507 3977 | (+86) 138 2318 0922 |
| 深圳灣管制站 | 香港神鹿旅運發展有限公司 | 6072 0219 2507 3977 | (+86) 138 2318 0922 |
| 深圳灣管制站 | 香港南方貿易旅運有限公司 | 2399 0393 | - |
落馬洲 | 快達香港豪華客車有限公司 | 2230 3760 | (+86) 132 6697 5301 |
文錦渡管制站 | 快達香港豪華客車有限公司 | 2230 3760 | (+86) 132 6697 5301 |
文錦渡管制站 | 利迅投資有限公司 | 9353 0200 6222 0991 2230 3760 | (+86) 132 6697 5301 |
| 文錦渡管制站 | 香港南方貿易旅運有限公司 | 2399 0393 | - |
香園圍管制站 | 粵港汽車運輸聯營有限公司 | 6330 3396 | - |
港珠澳大橋 香港口岸 | 快達香港豪華客車有限公司 | 2230 3760 | (+86) 132 6697 5301 |
